首都医科大学附属北京友谊医院始建于1952年，原名为北京苏联红十字医院，是新中国成立后，由党和政府建立的第一所大型综合性医院。建院初期，毛泽东、周恩来、刘少奇、朱德等老一辈革命家为医院亲笔题词，毛泽东主席题词“减少人民的疾病，提高人民的健康水平”。1957年3月，苏联政府将医院正式移交我国政府，周恩来总理来院参加了移交仪式。1970年，周总理亲自命名为“北京友谊医院”。

经过70年的发展，首都医科大学附属北京友谊医院已发展为集医疗、教学、、预防和保健为一体的北京市属三级甲等综合医院，是首都医科大学第二临床医学院，拥有北京临床医学研究所、北京热带医学研究所、北京市中西医结合研究所、北京市临床药学研究所和北京市卫生局泌尿外究所等5个研究机构。进入新时代，医院顺应首都发展变化，立足北京“四个中心”功能定位，落实北京城市总体规划，服务非首都功能疏解，形成了西城院区、通州院区、顺义院区(在建)和城市副中心行政办公区门诊部“三区一部”新发展格局，为医院高质量发展奠定基础。

医院现有职工4700人，其中研究生导师149人，专业技术人员740人，和北京市级专业主委、副主委及核心期刊主编、副主编84人。目前共开放床位2306张，年门诊量310次，年出院患者9.15次。医院是北京市基本医疗保险A类定点医疗机构，已开通门诊、住院异地医保持卡结算服务，也是全国早承担干部保健及外宾医疗任务的医院之一。

医院综合优势明显，专科特色突出，共有临床医技科室43个。消化和泌尿系统疾病诊治，肝、肾移植，热带病和寄生虫诊治、中西医结合以及临床影像诊断和介入治疗等是医院的专业特色。2014年10月，医院获批成为国家消化系统疾病临床医学研究中心，2018年牵头成立北京市医院管理中心消化内科学科协同发展中心。

近年来，医院的医学科技创新能力显著提升，学科架构日臻完善，支撑平台不断强化，综合优势进一步凸显。医院拥有国家重点专科8个，博士点27个，硕士点32个，国家住院医师规范化培训专业基地17个，国家专科医师规范化培训试点基地4个,北京市重点实验室4个，北京市临床质控中心5个，北京市转化中心1个，还拥有支撑临床研究发展的国家消化系统疾病临床医学研究中心、北京市示范研究型病房、北京临床研究质促中心、ISO9001认证生物样本库、多中心互认医学伦理平台等。医院与海外院校长期保持学术交流合作，接待国外专家学者短期交流以及留学生来院参观见习。自2005年起，北京市李桓英医学基金会已资助北京市14批次共231名中青年科技人才出国前往世界院所学习深造。